絕對禁忌症主要集中於頭頸部鐵磁性植入物與深部腦刺激器;而癲癇病史、可能降低癲癇閾值的藥物/物質使用,以及神經或精神狀況不穩定者則屬於相對禁忌症,需依個別情況進行風險效益評估,而非一律排除治療。